یکی از نقاط ضعف این دستگاهها، کارایی محدود آنها روی برخی گونههای خاص حشرات است. به عنوان مثال، برخی گونههای حشرات ممکن است نسبت به امواج صوتی مقاوم باشند و بنابراین این دستگاه روی آنها تأثیری نداشته باشد.
اگر دستگاه در محیطهای شلوغ یا پر از وسایل نصب شود، ممکن است عملکرد آن کاهش یابد. امواج صوتی به موانع فیزیکی حساس هستند و برای تأثیرگذاری بهتر، نیاز به فضای باز دارند.
برخی دستگاهها ممکن است بر حیوانات خانگی مانند پرندگان یا جوندگان کوچک تأثیر بگذارند. بنابراین، اگر حیوان خانگی دارید، بهتر است قبل از استفاده از این دستگاهها اطلاعات کافی کسب کنید.
هزینه خرید دستگاههای دور کننده حشرات ممکن است نسبت به روشهای سنتی بیشتر باشد. البته در بلندمدت، این دستگاهها به دلیل مصرف کم انرژی میتوانند گزینهای اقتصادی باشند.